Milena Stanković je diplomirala i magistrirala na FMU u Beogradu u klasi profesora Mirka Isaeskog.

Dobitnik je velikog broja prvih i specijalnih nagrada na medjunarodnim i republičkim takmicenjima.

Usavršavala se radeći sa eminentnim fagotistima, kao što su: Volker Tesman, Rihard Galer, Henrik Rabien, Tomaš Františ, Carlo Colombo,  Marc Engelhart, Fredrik Ekdahl, Giorgo Mandolesi, Nikolaus Mahler.

Dobitnik je stipendije Dositeja za najbolje studente Republike Srbije za osnovne i master studije.

Kao solista, kamerni i orkestarski muzičar nastupala je širom zemlje kao i na mnogobrojnim festivalima i koncertima u Nemačkoj, Austriji, Norveškoj, Francuskoj…

Bila je stalni član Crnogorskog simfonijskog orkestra. U bogatoj koncertnoj karijeri aktivno nastupa sa orkestrima kao što su: Beogradska filharmonija, Simfonijski orkestar RTS-a, Orkestar opere i teatra Madlenianum, Crnogorski simfonijski orkestar, Niški simfonijski orkestar, Orkestar opere Narodnog pozorišta, Makedonska filharmonija.

Sa Niškim simfonijskim orkestrom je tri puta nastupala kao solista.

Hummelov koncert za fagot u njenom izvođenju izdat je na CD-u revije klasične muzike Muzika Klasika.

Bila je član žirija republičkog kao i mnogih medjunarodnih takmičenja.

Od 2017.godine radi na mestu profesora fagota u Muzičkoj školi Stanković u Beogradu gde njeni učenici osvajaju veliki broj nagrada na republičkim i međunarodnim takmičenjima. Od 2019.godine radila je kao profesor fagota u muzičkoj školi Petar Konjović u Beogradu, a od 2023. radi i kao profesor fagota i u muzičkoj školi Vatroslav Lisinski.