Милена Станковић је дипломирала и магистрирала на ФМУ у Београду у класи професора Мирка Исаеског.

Добитник је великог броја првих и специјалних награда на медјународним и републичким такмицењима.

Усавршавала се радећи са еминентним фаготистима, као што су: Волкер Тесман, Рихард Галер, Хенрик Рабиен, Томаш Франтиш, Карло Коломбо,  Марк Енгелхарт, Фредрик Екдал, Ђорђо Мандолеси, Николаус Малер.

Добитник је стипендије Доситеја за најбоље студенте Републике Србије за основне и мастер студије.

Као солиста, камерни и оркестарски музичар наступала је широм земље као и на многобројним фестивалима и концертима у Немачкој, Аустрији, Норвешкој, Француској…

Била је стални члан Црногорског симфонијског оркестра. У богатој концертној каријери активно наступа са оркестрима као што су: Београдска филхармонија, Симфонијски оркестар РТС-а, Оркестар опере и театра Мадленианум, Црногорски симфонијски оркестар, Нишки симфонијски оркестар, Оркестар опере Народног позоришта, Македонска филхармонија.

Са Нишким симфонијским оркестром је три пута наступала као солиста.

Хуммелов концерт за фагот у њеном извођењу издат је на ЦД-у ревије класичне музике Музика Класика.

Била је члан жирија републичког као и многих медјународних такмичења.

Од 2017.године ради на месту професора фагота у Музичкој школи Станковић у Београду где њени ученици освајају велики број награда на републичким и међународним такмичењима. Од 2019.године радила је као професор фагота у музичкој школи Петар Коњовић у Београду, а од 2023. ради и као професор фагота и у музичкој школи Ватрослав Лисински.